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医学代谢服务 - 代谢物Biomarker筛选

  产品简介

代谢组反应营养、胁迫或者状态的速度比转录组或者蛋白质组要快得多,这使得代谢组在研发领域有很好的应用。"广泛靶向代谢组"是一种全新的代谢物检测定性、定量检测技术,它结合了非靶向、靶向的优点,将高通量、高灵敏度和定量的优点集合于一起,特别适合检测中低丰度代谢产物,是发现新代谢物Biomarker的最适方法。

  • 应用领域
  • 新的代谢物Biomarker发现
  • 效用评价
  • 技术特点
  • 同时检测近千种水溶、脂溶性代谢物
  • 高灵敏度,发现低丰度代谢物
  • 寻找代谢物Biomarker;
  • 自建代谢物数据库,既检测已知代谢物也发现新代谢物,并予以精确定量
  • 技术优势
  • 采用基于AB SciexQTRAP® 4500 LC/MS (UPLC)液质联用仪的"广泛靶向代谢组"技术,批量获得中低丰度代谢组图谱,为发现新的代谢物Biomarker提供技术基础。
  • 代谢物提取经验丰富:可处理各种体液(血清、血浆、尿液等),血细胞,组织样本。
  • 提供简洁通用的数据分析结果及图表,如PCA,PLS-DA, Welch's t-test, FDR, fold change等,并根据各种统计结果制作火山图和韦恩图,并给出定量分析结果列表。
  • 定制分析:累积风险预测与临床数据表型的相关性分析等;结合测序/芯片数据、蛋白质组、meta等多组学数据进行关联分析。
  • 技术路线

代谢组样品要求

1.样品类型
血清/血浆:500ul/例,不得低于200ul/例,不能反复冻融。如果用血浆请用肝素钠抗凝。血液收集在离心管中静置30分钟进行凝固。然后离心取上清装载干净的离心管中,再离心5分钟,8000rpm,取上清分装到冻存管中,每管0.5ml,-80度冻存寄送,不得反复冻融。
尿液:1ml/例,可多取一点。尿液直接分装到离心管中,每管1ml,添加一滴(约10ul)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠,-80度冻存寄送,不得反复冻融。
组织:100 mg/样品,钻孔离心管分装,获取后立即放置液氮中,-80度冻存寄送,不得反复冻融。

2.生物学重复:
临床标本设计不低于10例平行样品

3.保存和运输:
样品请置于 1.5 ml 管或合适管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用 Parafilm 封口。建议在运输前将所有样品管固定于 50 ml 带盖离心管中,再将 50 ml 管放在封口袋中。干冰运输,不能反复冻融。

 

参考文献

  • Y Xu,X Zheng,Y Qiu. et al. Distinct Metabolomic Profiles of Papillary Thyroid Carcinoma and Benign Thyroid Adenoma. J. Proteome Res. 2015,14(8): 3315–3321
  • Mapstone M, AK. Cheema, MS. Fiandaca. et al. Plasma phospholipids identify antecedent memory impairment in older adults. Nature Med. 2014 Apr;20(4): 415-8.