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医学代谢服务 - 非靶向代谢组

产品简介

非靶向代谢组(untargeted metabolomics)是一种常用的代谢组学研究方法,主要研究思路为对比实验组和对照组,检测样本中所有代谢物,并获取定量信息,主要研究思路为对比实验组和对照组,检测样本中所有代谢物,并获取定量信息,找到不同组别之间的差异代谢物和代谢通路,可为疾病生物标志物开发,疾病发病机制和药物治疗机制等研究提供线索和方向。

 

应用领域

1.寻找疾病的生物标志物

2.研究疾病发病相关的代谢通路

3.预测药物的疗效和不良反应

4.评估中医中药的疗效和安全性

 

研究平台

采用Agilent 1290 Infinity ⅡUHPLC-Agilent 6545(Q-TOF LC/MS),Agilent 1290 Infinity ⅡUHPLC具有更高的色谱分离度,具有极低的检测限和超宽的动态范围;Agilent 6545具有更高的灵敏度和出色的稳定性,二者结合提供更高的分离能力和灵敏度,得到更准确的分析结果。

1.血清或血浆:200μl/sample;液氮速冻后-80℃保存,干冰寄送。注意检查是否有溶血,如果发生溶血,重新采样。

2.尿液:≥500μl/sample;液氮速冻后-80℃保存,干冰寄送

3.组织:200mg/sample;液氮速冻后-80℃保存,干冰寄送

4.细胞:≥1×106/sample;液氮速冻后-80℃保存,干冰寄送

Prediction of chemotherapeutic efficacy in non-small cell lung cancer by serum metabolomic profiling

基于血清代谢组学分析预测非小细胞肺癌的化疗有效性

CLINICAL CANCER RESEARCH   IF:10.144

研究思路

1.收集了354例非小细胞肺癌患者经化疗前的血清,入组患者均接受肺癌一线化疗方案培美曲塞加铂类药物(顺铂或卡铂)进行治疗。经治疗后肺癌患者按有效性可分为三组,即疾病进展组(PD),部分响应组(PR)和稳定疾病组(SD)。将这三组病人经化疗前的血清采用LC-MS/MS进行代谢组学分析。

2.找到3组之间的差异代谢物作为潜在的生物标志物,并经各种算法由数种代谢物组成的panel,并将该panel进行ROC分析判断其敏感性和特异性。

3.为了验证该panel的区分能力,基于无进展生存期(PFS)对其潜在的预测能力进行了分析。为了进一步说明该panel的预后预测能力,运用逻辑回归模型进行分析,并将预测结果与临床CT成像结果进行比较。

 

 

研究结论

该研究首次使用非把代谢组学大队列研究寻找能预测培美曲塞+铂类药物治疗肺癌有效性的生物标志物,建立了由7个代谢物组成的生物标志物panel的区分模型,且该区分模型能较好地预测培美曲塞+铂类要去治疗肺癌的有效性,该预测模型可用于选择受益于培美曲塞+铂类药物治疗肺癌的患者。

 

参考文献

1. Fan Y, Li Y, Chen Y, Li P, Qi LW et al, Comprehensive Metabolomic Characterization of Coronary Artery Diseases. Journal of the American College of Cardiology. 2016.

2. Yanhua Tian,Zhijie Wang,et al.Prediction of Chemotherapeutic Efficacy in Non-Small Cell Lung Cancer by Serum Metabolomic Profiling. Clin Cancer Res. 2018.