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代谢组的概述

  • 发布时间:2021-02-14 11:15
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【概要描述】对于代谢组学技术来说,2010年之前的主要瓶颈是可以鉴定的代谢物种类较少,通常在100种以内,因此代谢组学的价值就丧失了。随着技术的发展,代谢组学可以测量300多种代谢物,近期的研究也在增加。代谢组学检测的技术路线通常是在一定压力下使用液相色谱(气相色谱)。不同分子量和电荷的代谢物在塔盘柱中以不同的速度流动,从而分离不同分子量的代谢物。然后根据分子的荷质比不同,质谱仪中的飞行偏转角不同,导致降落点

代谢组的概述

【概要描述】对于代谢组学技术来说,2010年之前的主要瓶颈是可以鉴定的代谢物种类较少,通常在100种以内,因此代谢组学的价值就丧失了。随着技术的发展,代谢组学可以测量300多种代谢物,近期的研究也在增加。代谢组学检测的技术路线通常是在一定压力下使用液相色谱(气相色谱)。不同分子量和电荷的代谢物在塔盘柱中以不同的速度流动,从而分离不同分子量的代谢物。然后根据分子的荷质比不同,质谱仪中的飞行偏转角不同,导致降落点

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对于代谢组学技术来说,2010年之前的主要瓶颈是可以鉴定的代谢物种类较少,通常在100种以内,因此代谢组学的价值就丧失了。随着技术的发展,代谢组学可以测量300多种代谢物,近期的研究也在增加。


代谢组


代谢组学检测的技术路线通常是在一定压力下使用液相色谱(气相色谱)。不同分子量和电荷的代谢物在塔盘柱中以不同的速度流动,从而分离不同分子量的代谢物。然后根据分子的荷质比不同,质谱仪中的飞行偏转角不同,导致降落点不同。根据不同的着陆点信息,与数据库进行比较,确定代谢物的类型。因此,在代谢组学中,数据库是否完整成为鉴定代谢物的关键。通常的做法是使用标准代谢物进行液相色谱质谱联用,并记录它们的信息以形成数据库。然后,待测样品在用于液相色谱-质谱联用时会形成自己独特的峰形,其类型和相对含量可以通过与数据库的比较来确定。
代谢组学的数据分析思路如下:描述和检测代谢物的类型;PCA成分分析确定同组代谢物的稳定性(即组内重复性和组间差异);筛选差异代谢物;信号转导途径;其中分布着不同的代谢物;差异代谢物随时间或大于阶段的变化规律分析;分子标记的筛选。当然,根据实验目的的不同,也有特殊的分析模式。
近年来,随着基因组学和转录组学、转录组+代谢组的发展,组合代谢物分析已经成为一种流行趋势,它不仅从现象中检测不同的代谢物,而且从基因水平解释代谢物变化的原因,反之,基因水平的变化导致代谢物变化。核酸修饰也发展很快。

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