产品描述
生命科学研究样本类型繁多，除了大规模组织（大脑、肾脏、植物根茎叶果实）外，还有些微量样本类型，如穿刺样本、花粉、卵细胞以及一些细胞器，这些样本较难获得，无法满足蛋白质组学需求。迈维代谢特推出4D-microDIA微量蛋白质组，可满足部分微量样本研究需求。
- 产品介绍
目前针对微量样本蛋白组检测主流方法有iST、SP3和SISPROT，其中SISPROT技术表现优异。SISPROT技术原理如下图，其核心为中间的蛋白消化装置。蛋白质消化装置主体为SISPROT吸头，SISIPROT包含了SAXdisk和C18disk两部分，分别起到蛋白富集和肽段富集作用。富集好的肽段采用timsTOF Pro2质谱仪diaPASEF技术进行检测。
SISPROT技术原理（Wendong Chen et al,2017）
- 技术优势
（1）样本量少：仅需2ug蛋白即可满足实验需求；
（2）仪器先进：基于高端质谱仪timsTOF Pro2建立微量蛋白组检测流程，硬件设施保证蛋白检出数及稳定性;
（3）高灵敏度：10000个细胞或100 ng可以稳定检测到约6000种蛋白质。
（4）专属蛋白功能数据库：开创性对 16 种国际数据库进行总结，包含蛋白质、疾病、药物对应关系，提高数据挖掘效率。
应用方向：
♦ 医学研究
疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
♦ 动物研究
动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
♦ 植物研究
植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
♦ 微生物
致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理
样本要求：
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适用产品 |
样本类型 |
样本 |
推荐送样量 |
最低送样量 |
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4D-microDIA微量蛋白组 |
固体组织 |
常规组织 |
0.1-5mg |
/ |
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冰冻切片 |
≥3片 |
1片 |
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FFPE切片 |
≥5片 |
/ |
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FFPE打孔 |
1针 |
/ |
||
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液体 |
血浆/血清 |
1ul |
/ |
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细胞 |
哺乳动物细胞 |
10000个 |
2000个 |
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卵细胞 |
10个 |
/ |
研究案例：
通过全自动化蛋白组样品制备高通量探索药物靶标
期刊：Chemical Science，发表时间：2024.01，影响因子：8.4
研究背景：
由于药物疗效不足和意外毒性等问题，药物开发受到低效率和高成本的困扰。基于质谱（MS）的定量蛋白质组学，为揭示与脱靶途径相关的耐药性机制和不可预见的副作用提供了一个解决方案。
研究思路：
研究结果：
autoSISPROT和diaCETSA联合鉴定激酶抑制剂高通量药物靶点
研究结论：
文中提出了一个高通量药物靶点发现工作流程，该工作流程集成了 single-temperature TPP、全自动蛋白质组学样品制备平台（autoSISPROT）和数据独立采集模式（DIA）。通过自动处理87个样本，文中确定了20种激酶抑制剂已知靶点和潜在脱靶点，与经典TPP相比，其吞吐量提高了10倍以上。这种全自动工作流程为蛋白质组学样品制备和药靶/脱靶鉴定提供了一个高通量解决方案。
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