
产品介绍
PRODUCTS
16S,ITS,18S扩增子
一、产品简介:
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获片段进行测序,研究微生物多样性及群落组成和丰度差异。16S/ITS/18S扩增子测序是对样本中细菌的16S rRNA,真菌的ITS和真核生物(藻类等)的18SrRNA基因序列进行高通量测序,序列既具有保守性,又具有高变性。通过对某一段高变区序列(如16S的 V3-V4区域,ITS的ITS1区域或18S的V4区域)或全长进行PCR扩增后进行高通量测序,与数据库比对得到物种注释信息,可以了解样本中的菌群组成及丰度,以及组间差异菌群。
二、技术优势:
◆ 直接对菌群样本中的微生物特征序列进行扩增检测,简单快速且性价比高,并克服了绝大部分微生物无法纯培养的难题;
◆ 每个样本一次性获得数万条序列,即使低丰度物种也能精确定量;
◆ 多种物种注释数据库可选,根据样本来源按需选择Greengenes/Silva/Unite等数据库,优化物种的分类鉴定;
◆ 可对菌群进行代谢功能预测,指导后续宏基因组测序研究。
三、技术路线:
四、分析内容:
五、样本要求:
样本类型 |
建议样本量 | 最低样本量 | 生物学重复 |
---|---|---|---|
粪便/肠道内容物 |
2g(小鼠6-10粒) |
0.5g(小鼠2-3粒) |
至少6个重复,建议10个以上,临床样本30个以上 |
拭子 |
3个 |
1个 |
|
瘤胃液/发酵液/组织液/冲洗液(离心有明显沉淀) |
3mL,沉淀1g |
1mL,沉淀0.5g |
|
组织 |
1g |
0.5g |
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