产品介绍
PRODUCTS
16S，ITS，18S扩增子
一、产品简介：
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获片段进行测序，研究微生物多样性及群落组成和丰度差异。16S/ITS/18S扩增子测序是对样本中细菌的16S rRNA，真菌的ITS和真核生物（藻类等）的18SrRNA基因序列进行高通量测序，序列既具有保守性，又具有高变性。通过对某一段高变区序列（如16S的 V3-V4区域，ITS的ITS1区域或18S的V4区域）或全长进行PCR扩增后进行高通量测序，与数据库比对得到物种注释信息，可以了解样本中的菌群组成及丰度，以及组间差异菌群。
二、技术优势：
◆ 直接对菌群样本中的微生物特征序列进行扩增检测，简单快速且性价比高，并克服了绝大部分微生物无法纯培养的难题；
◆ 每个样本一次性获得数万条序列，即使低丰度物种也能精确定量；
◆ 多种物种注释数据库可选，根据样本来源按需选择Greengenes/Silva/Unite等数据库，优化物种的分类鉴定；
◆ 可对菌群进行代谢功能预测，指导后续宏基因组测序研究。
三、技术路线：
四、分析内容：
五、样本要求：
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样本类型 |
建议样本量 | 最低样本量 | 生物学重复 |
|---|---|---|---|
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粪便/肠道内容物 |
2g（小鼠6-10粒） |
0.5g（小鼠2-3粒） |
至少6个重复，建议10个以上，临床样本30个以上 |
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拭子 |
3个 |
1个 |
|
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瘤胃液／发酵液／组织液／冲洗液（离心有明显沉淀） |
3mL，沉淀1g |
1mL，沉淀0.5g |
|
|
组织 |
1g |
0.5g |
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