蛋白质组学是理解基因功能最重要的方法之一,它比基因组复杂的多。定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是蛋白质组学研究领域最重要的应用之一,可以对样品之间蛋白质水平变化进行定量比较。
- 产品介绍
迈维代谢基于Orbitrap Astral或timsTOF Pro2质谱仪DIA扫描方法建立了 Ultra-Fast定量蛋白组检测流程。0rbitrap Astral或timsTOF Pro2质谱仪不仅能够提高扫描速度与灵敏度,而且使 DIA 数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时,降低谱图复杂度和提高离子利用率,实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
DIA原理示意图(Krasny L et al,2021)
- 技术优势
(1)仪器先进:基于高端质谱仪Orbitrap Astral和timsTOF Pro2建立蛋白组检测流程,硬件设施保证蛋白检出数及稳定性;
(2)样本量少:前处理经验丰富,样本量少,常规动物组织仅需5mg;
(3)通量高:满足大队列项目;
(4)检出多:蛋白检出数量达8000+;
(5)专属蛋白功能数据库:开创性对 16 种国际数据库进行总结,包含蛋白质、疾病、药物对应关系,提高数据挖掘效率。
应用方向:
♦ 医学研究
疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
♦ 动物研究
动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
♦ 植物研究
植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
♦ 微生物
致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理
样本要求:
适用产品 |
样本类型 |
样本 |
推荐送样量 |
最低送样量 |
Ultra-Fast定量蛋白质 |
动物组织 |
常规组织(心、肝、脾、肺、肠、肾等) |
30mg |
5mg |
骨头 |
1g |
200mg |
||
毛发 |
500mg |
200mg |
||
昆虫全虫及非壳(甲)组织部位 |
200mg |
100mg |
||
皮肤、脂肪组织、滑膜 |
200mg |
100mg |
||
植物组织 |
幼嫩组织(嫩叶、花瓣、愈伤组织) |
50mg |
20mg |
|
成熟组织(叶片,幼嫩茎、藻类、大型真菌(蘑菇) |
500mg |
200mg |
||
树皮、根、果实 |
1g |
500mg |
||
花粉 |
40mg |
15mg |
||
橡胶胶乳 |
400ul |
200ul |
研究案例:
COVID-19 疾病早期的免疫抑制
期刊:Nature Communication,发表时间:2021.11,影响因子:14.919
研究背景:
北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰主任团队,中国科学院高福院士团队等人开展协同研究,使用基于DIA的定量蛋白质组学技术,发现早期的新冠感染患者存在着显著的免疫抑制,并首次提出COVID-19的发病机制或存在“两阶段”模式。
研究思路:
研究结果:
免疫系统在新冠肺炎病的早期受到抑制
重症新冠肺炎病患者的免疫反应被激活
研究结论:
该工作采用了4D-蛋白质组方法,揭示了感染初期免疫抑制和COVID-19患者紧密相关。与早期相比,在感染的后期,免疫反应在一定程度上被激活。这些研究提供了与COVID-19疾病相关的分子变化图谱,并为可能发生的两期发病机制提供了线索。
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