
多组学产品
Multi-omics products
1.产品简介:
蛋白翻译后修饰(post-translation modifications,PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程,通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,可以改变蛋白质的理化性质,进而影响蛋白质的空间构象和活性状态,亚细胞定位,折叠机器稳定性及蛋白互作。蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生相应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质的分子质量,但是含量低且动态范围大,需要针对不同修饰类型采用相应富集方法。常见的蛋白翻译后修饰主要有磷酸化、乙酰化、糖基化和泛素化等。
2.技术优势:
◆ 高特异性的修饰抗体;
◆ 高分辨率、高灵敏度质谱仪;
◆ 鉴定通量高;
◆ 可与代谢组学等进行多组学联合分析。
3.文献案例:
Ubiquitinome Profiling Reveals the Landscape of Ubiquitination Regulation in Rice Young Panicles
关键词:水稻幼穗、泛素化
- 期刊:Genomics, Proteomics & Bioinformatics
- IF:7.051
- 发表时间:2020
研究路线:
水稻幼穗进行蛋白泛素化修饰组和磷酸化修饰组检测
研究结果:
1. 水稻幼穗修饰组概况:共鉴定到916个蛋白上的1,638个泛素化修饰位点,鉴定了18210个蛋白和43903个磷酸化位点。
2. 功能富集分析和蛋白互作分析:通过GO和KEGG数据库对鉴定到的泛素化修饰蛋白展开功能分析,结果表明泛素化修饰蛋白参与了许多对水稻幼穗花药发育至关重要的基本细胞过程,PPI结果表明泛素化修饰蛋白质广泛参与不同的途径。
3. 泛素化修饰蛋白参与水稻花药发育和籽粒发育:鉴定到的SRS5、HGW和qNPT1与水稻籽粒大小相关,这表明泛素化在调节稻米粒大小中起着重要作用。
4. 泛素化修饰验证:对OsDRUS1和OsOTUB1进行了Co-IP和WB实验,结果证实了OsDRUS1和OsOTUB1在水稻幼穗中具有泛素化修饰,表明了泛素化修饰组学分析的可靠性。
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