空间可视化蛋白组
1. 技术原理
整合多种先进技术,包括多靶点组织原位微环境单细胞成像以及SISPROT全集成化高灵敏度样品前处理技术等。显微切割使用激光作为显微手术刀,可以单细胞分辨率从组织切片中选择性地分离特定细胞类型或感兴趣区域(ROI)。完整收集ROI区域后,采用SISPROT前处理并进行质谱检测,可对纳克级样品实现毫克级别样品检测深度。
SISPROT技术流程(Tian et al.Anal Chem.2018)
2. 检测流程
3. 技术优势
4. 应用方向
5. 经典案例
Clinical functional proteomics of intercellular signaling in pancreatic cancer
期刊:Nature 技术方法:空间可视化蛋白组 发表时间:2024.11.13
研究结论:胰腺导管腺癌(PDAC)具有一种非典型的、富含间质的肿瘤微环境(TME),这对其不良预后有着深远的影响。在此,为了更好地直接了解PDAC肿瘤中癌细胞与间质细胞之间的细胞间信号传导,本研究开发了一种名为TMEPro的多维蛋白质组学策略。将TMEPro应用于对100个人类胰腺组织样本的糖基化分泌和细胞膜蛋白质组进行深度剖析,定义细胞类型起源并识别潜在的旁分泌相互作用,特别是通过酪氨酸磷酸化介导的相互作用。在遗传工程改造的PDAC小鼠模型中研究了胰腺肿瘤进展过程中的时间动态。从功能上揭示了间质细胞与癌细胞之间通过间质PDGFR-PTPN11-FOS信号轴介导的相互信号传导。此外研究了PDAC肿瘤中细胞膜蛋白的通用脱落机制,并揭示了基质金属蛋白酶介导的AXL受体酪氨酸激酶胞外段脱落为PDAC TME中的细胞间信号传导调控提供了额外的维度。重要的是,脱落的AXL水平与淋巴结转移存在潜在的相关性,而且抑制AXL脱落及其激酶活性在抑制癌细胞生长方面显示出显著的协同效应。总之本研究可以为更好地理解PDAC TME以及促进新的诊断和治疗靶点的发现提供了一个全面的资源。
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