imgboxbg

产品介绍

PRODUCTS

浏览量:
1000

全转录组测序

零售价
0.0
市场价
0.0
浏览量:
1000
产品编号
数量
-
+
库存:
0
1
产品描述

1.产品概述

全转录组,广义层面上的全转录组指细胞中能转录出的所有RNA的综合;狭义层面指mRNA以及具有调控功能的非编码RNA。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用small RNA(比如miRNA)、长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)和环状RNA(circle RNA, circRNA)。

全转录组测序,可同时对同一样本中具有编码功能的mRNA和具有调控功能的非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)包括small RNA(以miRNA为代表),长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)和环状RNA(circular RNA, circRNA)进行测序,并对这四者之间复杂的相互作用关系进行分析。

 

2.应用领域

◆ 细胞分化和生长发育研究

◆ 调控机理研究

◆ 动植物抗性及适用性机制研究


3.技术路线

 

 

4.技术参数

(1)样本要求

新鲜动物组织0.8g

新鲜培养细胞:5×107

新采集的全血:10ml

PAXgene 采血管:5

RNA要求:

样品浓度:≥150 ng/ul

样品体积:>15ul

样品总量:>5ug

样品纯度:RIN≧6.8 (动物)、6(植物、真菌),OD260/280≧1.8,OD260/OD230≧1

(2)测序策略:mRNA+LncRNA+CircRNA:PE150;Small RNA:SE50

(3)推荐数据量:12G+10M

(4)测序平台:Novaseq

 

5.案例分析

miR-185 Inhibits Fibrogenic Activation of Hepatic Stellate Cells and Prevents Liver Fibrosis

miR-185抑制肝星状细胞的纤维化激活,防止肝纤维化

期刊:Mol Ther Nucleic Acids

IF:5.919发表时间:2018.03

研究单位:北京地坛医院

研究结论

近年来的研究表明microRNAs对星状细胞的激活和转化有一定的作用,这在肝纤维化的发病机制中是必不可少的。本研究总作者探索了miR-185在肝纤维化中的作用。采用Illumina HiSeq测序法检测乙肝病毒相关肝纤维化患者(S2/3, n = 10)的血浆miR-185,并选择健康志愿者(n = 8)作为对照组。发现纤维化患者的血浆miR-185水平显著下调。ccl4诱导的小鼠肝脏纤维化组织和tgfb1激活的星状细胞中,miR-185下调,RHEB和RICTOR表达增加。为了探究其相关性,我们在LX-2细胞中瞬时转染miR-185模拟物。a-SMA、I型胶原和III型胶原的表达水平以及RHEB和RICTOR的表达水平降低。抑制内源性miR-185增加了纤维形成活性。此外,双荧光素酶报告基因检测表明,miR-185通过直接靶向RHEB和RICTOR的30个utr抑制其表达。此外,沉默RHEB和RICTOR抑制了a-SMA和胶原蛋白的表达水平。总之,miR-185通过抑制RHEB和RICTOR来抑制星状细胞的激活,从而阻止肝纤维化的发生。这些结果为miR-185抗纤维化作用的机制提供了新的见解。

 

图1.ccl4诱导的小鼠肝纤维化下调miR-185,上调RHEB和RICTOR

 

参考文献

Zhou Li,Liu Shunai,Han Ming et al. miR-185 Inhibits Fibrogenic Activation of Hepatic Stellate Cells and Prevents Liver Fibrosis.[J] .Mol Ther Nucleic Acids, 2018, 10: 91-102.

 

扫二维码用手机看
未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

提交需求

请填写您的需求表格,我们会安排专业的工作人员与您联系!

留言应用名称:
医学客户留言
描述:
武汉迈特维尔生物科技有限公司

人力资源:027-87705246   客服电话:027-62433042   邮箱:support@metware.cn   地址:湖北省武汉市东湖技术开发区高新大道666号光谷生物城B8栋
武汉迈特维尔生物科技有限公司  版权所有   
鄂ICP备16008923号-1    迈维代谢.网址