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SmallRNA测序

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产品描述

1.产品概述

Small RNA 又称为小RNA,包括microRNA,siRNA,piRNA三类,属于非编码RNA。Small RNA测序一般收集样本中18-40nt的片段进行测序分析,研究特定组织在特定状态下的所有已知smallRNA,也可以发现新的smallRNA并预测其靶基因。

 

2.应用领域:

 ◆ 细胞分化和发育研究

 ◆ 调控机理研究

 ◆ 疾病标志物查找

 ◆ 疾病分子诊断

 ◆ 基因药物研发

3.技术路线

 

 

4.技术参数

(1)样本要求

新鲜动物组织≥0.5g

新鲜培养细胞:≥1×107

新采集的全血:≥8ml

PAXgene 采血管:3

RNA要求:

样品浓度:≥100 ng/ul

样品体积:>10ul

样品总量:>3ug

样品纯度:RIN≧6.8 (动物)、6(植物、真菌),OD260/280≧1.8,OD260/OD230≧1

(2)测序策略:SE50

(3)推荐数据量:10M

(4)测序平台:Novaseq

 

5.案例分析

Sperm microRNAs confer depression susceptibility to offspring

父亲精子microRNA变化使后代易患抑郁症

期刊:Science Advances 

IF:13.116  发表时间:2021

研究单位:南京鼓楼医院

研究结论:

近年来,人们认为精子RNA是除精子DNA外由父系传递卵母细胞遗传信息的另一重要来源。有研究发现,抑郁症会导致父本精子RNA表达谱发生变化,然而,抑郁症的病理症状是否可以通过精子RNA介导传递给下一代,引起子代的抑郁表型变化尚不清楚。本文中作者通过small RNA高通量测序和单细胞转录组测序技术,发现精子microRNA(miRNA)在抑郁样模型的F0雄性中表现出不同的表达谱,并在F1后代中重现了父亲抑郁样表型,发现精子miRNA在早期胚胎中通过调控神经系统发育相关基因表达,进而导致成年子代出现抑郁易感症状。

 

图1.来自抑郁模型的精子mirna在胚胎早期发育过程中引起转录级联变化

 

参考文献
Wang Yanbo,Chen Zhang-Peng,Hu Huanhuan et al. Sperm microRNAs confer depression susceptibility to offspring.[J] .Sci Adv, 2021, 7: undefined.

 

 

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