我们主要使用LC-MS/MS与GC-MS进行代谢物检测，部分检测会使用到600 MHz NMR。

目前效率最高的代谢物检测方法是基于LC-MS/MS平台的“广泛靶向代谢组”技术，该方法整合传统靶向、非靶向检测技术优点，能同时定性、相对定量，实现了高通量、高灵敏度、靶向代谢物检测。一次检测数百种代谢物，且主要为中低丰度次生代谢产物。

我们利用标准品比对等多种手段，建立了上千种代谢物的LC-MS/MS数据库。库里包括酚胺类、萜类、生物碱、黄酮类、激素及其衍生物、氨基酸及其衍生物、核苷酸及其衍生物、脂肪酸等。不同物种、不同组织能鉴定到的代谢物不一样，通常是一百种至数百种。

将测序数据与代谢组数据结合，进行基因定位、研究基因功能、搞清楚关键性状的核心代谢通路。利用该技术我们近两年在Nat Genet、Nat Commun、PNAS、Plant Cell、Plant J、Curr Opin Plant Biol等杂志发表代谢组学相关论文多篇。

非靶向一般是检测到2000-3000的质谱峰，而非代谢物，需要对质谱峰搜库比对鉴定代谢物，往往最终能鉴定到的物质不多。且能明确分离到的峰都是检测信号强度10000到100000的，基本上以高丰度的初生代谢物为主。

广泛靶向检测的信号低至100，也就是说灵敏度是非靶向的100倍，这样能检测到大量的低丰度、次生代谢物，同时通过我们的库及其他鉴定手段，可以鉴定出代谢物是什么。

环境影响代谢物丰度是毫无疑问的，因此实验要求控制环境变量，同一批实验要在同一地区、同一时间混合采样。

不过并非代谢组实验就一定要取不同地点、不同年份，因为这是组学研究，数据量大，是从海量数据中找差异，因此把握主要矛盾，同一批次控制好环境变量，就会找到有价值的差异;另外，我们的方法灵敏度高，定量准，鉴定到的代谢物在不同样本间差异大(10-10000倍)，十分有利于排除环境变量的影响从而找到有价值的差异信息。

请参考网站“技术支持----样品要求”部分。