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扩增子

扩增子测序是一种通过引物对特定区域进行扩增,再对特定长度PCR产物或者捕获片段进行测序,可用于研究样本中微生物群落组成及其丰度差异。根据研究对象的不同可分为16S/ITS/18S测序。16S测序可以鉴定特定环境中细菌的种类和丰度,ITS/18S测序可以鉴定特定环境中真菌/藻类的种类和丰度。
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产品编号
所属分类
扩增子
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关键词:
16S
16S rRNA
ITS
18S
细菌
真菌
扩增子
目标区域扩增
NGS测序
功能预测
V4
V3-V4
多样性
OTU
ASV
微生物组
1
产品描述

产品简介:

微生物扩增子测序是指对环境样本中(如:肠道环境,土壤环境等)细菌、真菌进行特异性扩增,并对扩增产物进行高通量测序,进而对环境中微生物群落结构进行分析的方法。随着高通量测序平台的不断发展,扩增子测序主要采用Illumina测序平台的PE250测序策略。

从DNA样本到最终数据的过程中,样本检测、PCR、纯化、文库制备和测序等每一步都会影响数据的质量和数量,而数据质量将直接影响后续的信息分析结果。为了保证测序数据的准确性和可靠性,在实验的每个步骤都进行了严格的质量控制。

应用方向:

· 医学方向:biomarker筛选、功能性研究、机制研究

· 植物方向:叶际微生物互作研究、根际微生物互作研究

分析流程: