DIA定量蛋白组
产品介绍:
数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式,融合了传统蛋白质组学“鸟枪法”(shotgun)和质谱绝对定量“金标准”选择反应监测/ 多反应监测(SRM/MRM)技术的优势和特点。可以依据质荷比(m/z)将质谱整个扫描范围分为若干个窗口,然后对每个窗口中的所有母离子进行碎裂、检测,采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。与传统数据依赖采集模式(DDA)相比,具有全景式扫描、数据利用度高、重复性高、定量准确性高、数据可回溯等优势。因此,DIA技术能够得到更准确更丰富的结果,适合于大样本量、复杂体系的蛋白检测。
技术优势:
(1)使用内标校正肽段(iRT KIT)对不同样品的保留时间进行校正,鉴定与定量结果的可重复性高;
(2)无需使用昂贵的同位素标签,实验耗费低;
(3)前处理操作过程较少,使样本最接近原始状态,同时不受样品条件限制;
(4)通量高,不受样品个数的限制,可用于大规模样本数量检测;
(5)减少了低丰度母离子和碎片离子的丢失,大大提高了高分辨质谱二级定量的通量。
应用方向:
♦ 医学研究
疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
♦ 动物研究
动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
♦ 植物研究
植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
♦ 微生物
致病机制及耐药性研究、胁迫相关蛋白筛查及机制研究、环境作用机理
样本要求:
适用产品 |
样本类型 |
样本 |
推荐送样量 |
最低送样量 |
DIA定量蛋白组 |
固体 |
动物组织 |
100mg |
50mg |
植物组织 |
200mg |
100mg |
||
液体 |
血清/血浆 |
20μL |
5μL |
|
细胞上清 |
30mL |
15mL |
||
外泌体 |
25μL |
15μL |
||
细胞 |
细胞 |
1×106 |
5×105 |
|
其他 |
蛋白质 |
50μg |
/ |
研究思路:
In-depth serum proteomics reveals biomarkers of psoriasis severity and response to traditional Chinese medicine
血清蛋白质组学鉴定银屑病及其中药疗效的生物标志物
期刊:Theranostics,发表时间:2019.04,影响因子:11.556
研究背景:
血清和血浆含有丰富的生物信息,如蛋白质,反映了人体的生理和病理状况,因此血液蛋白质可作为疾病生物标志物。随着质谱技术的发展,有着更高定量准确性和重现性的DIA (Data Independent Acquisition)技术,可在血液中鉴定到数百种蛋白。本文对银屑病患者的血液标志物及其对中药响应的标志物进行了探索。
研究思路:
研究结果:
DIA检测银屑病患者血清蛋白
研究结论:
本研究对银屑病血清蛋白质组分析,发现了其潜在的生物标志物,并在独立验证集中对PI3进行了ELISA验证。结果证明了深入的血清蛋白质组学平台在识别银屑病和其他免疫介导疾病的特定诊断和预测生物标志物方面的临床实用性。
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