4D-label free蛋白组
产品介绍:
Label-free定量蛋白质组学技术因为其操作简单、不依赖于昂贵的标记试剂、单次实验不受样品数限制等独特优势而备受广泛重视。但传统的label-free技术由于受质谱仪灵敏度和扫描速度等性能的限制,在不分级的情况下检测深度往往无法达到科研要求,因此大多数人采用诸如TMT/iTRAQ的标记定量方法。4D label-free技术借助timsTOF Pro2特有的双TIMS设计和ddaPASEF®采集模式,检测灵敏度在传统label-free基础得到了约12倍的提升。由于4D label-free技术的定量信息比传统label-free多了一维离子淌度信息,使得定量结果更准确,定量可重现性更好。
4D label-free定量示意图
技术优势:
(1)覆盖度更深,尽量不丢失蛋白质;
(2)定性更准确,结果可信度高;
(3)更稳定,定量更准确,数据更可靠;
(4)通量高,满足大队列项目;
(5)低样本量,更好满足临床样本少等问题。
应用方向:
♦ 医学研究
疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
♦ 动物研究
动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
♦ 植物研究
植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
♦ 微生物
致病机制及耐药性研究、胁迫相关蛋白筛查及机制研究、环境作用机理
样本要求:
研究思路:
Ultrafast and Reproducible Proteomics from Small Amounts of Heart Tissue Enabled by Azo and timsTOF Pro
Azo和timsTOF Pro实现了少量心脏组织的超快和可重复的蛋白质组学
期刊: J Proteome Res,发表时间:2021.04,影响因子:4.466
研究背景:
基于全局自下而上质谱 (MS) 的蛋白质组学广泛用于蛋白质鉴定和定量,以全面了解蛋白质组的组成、结构和功能。然而,传统的样品制备方法非常耗时,通常包括过夜胰蛋白酶消化、广泛的样品净化以去除与 MS 不相容的表面活性剂,以及在在线液相色谱-串联质谱 (LC-MS/MS) 之前进行离线样品分级以降低蛋白质组复杂性) 分析。因此,需要一种快速、稳健且可重复的方法,用于从复杂蛋白质组中进行蛋白质鉴定和定量。
研究思路:
研究结果:
图 从少量组织中进行可重现的蛋白质鉴定和定量
研究结论:
作者开发了一种超快的自下而上的方法,用于定量和可重复地分析人类心脏蛋白质组。流程采用快速(30 分钟)胰蛋白酶消化而不牺牲蛋白质组覆盖率或可重复性,并且可以轻松缩小到少量组织从而实现了深度蛋白质组覆盖。
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