4D-DIA定量蛋白组
产品介绍:
DIA(Data-independent Acquisition,数据非依赖采集)策略则是将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,并循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,因此可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,缺失值更少。但传统DIA的数据采集策略会使得谱图高度复杂,给数据解析带来极大的挑战,并且其定量可靠性也存有一定的争议。4D-DIA技术借助timsTOF Pro2特有的双TIMS设计和DIA-PASEF®采集模式,检测灵敏度在传统DIA基础得到了提升。由于4D-DIA技术的定量信息比传统DIA多了一维离子淌度信息,使得定量结果更准确,定量可重现性更好。
4D蛋白组原理示意图
技术优势
(1)覆盖度更深,尽量不丢失蛋白质;
(2)定性更准确,结果可信度高;
(3)更稳定,定量更准确,数据更可靠;
(4)通量高,满足大队列项目;
(5)低样本量,更好满足临床样本少等问题。
应用方向:
♦ 医学研究
疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点
♦ 动物研究
动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究
♦ 植物研究
植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良
♦ 微生物
致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理
样本要求:
适用产品 |
样本类型 |
样本 |
推荐送样量 |
最低送样量 |
4D-DIA定量蛋白组 |
动物组织 |
常规组织(心、肝、脾、肺等) |
50mg |
30mg |
特殊组织(皮肤、毛发、骨头) |
200mg |
100mg |
||
植物组织 |
幼嫩组织 |
50mg |
20mg |
|
成熟组织(树皮、根、果实) |
1g |
500mg |
||
花粉 |
40mg |
15mg |
||
液体 |
血清/血浆(不去除高丰度蛋白) |
20uL |
5μL |
|
唾液/脑脊液/羊水/乳汁 |
200μL |
100uL |
||
尿液 |
5mL |
1mL |
||
细胞上清 |
25mL |
10mL |
||
唾液/脑脊液/羊水/乳汁 |
200μL |
100μL |
||
外泌体 |
25μL |
15μL |
||
细胞 |
原代细胞 |
3×106 |
1×106 |
|
传代细胞 |
1×106 |
5×105 |
||
其他 |
蛋白质 |
50μg |
30μg |
研究思路:
COVID-19 疾病早期的免疫抑制
期刊:Nature Communication,发表时间:2021.11,影响因子:14.919
研究背景:
北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰主任团队,中国科学院高福院士团队等人开展协同研究,使用4D-DIA(DIA-PASEF)蛋白质组学技术,发现早期的新冠感染患者存在着显著的免疫抑制,并首次提出COVID-19的发病机制或存在“两阶段”模式。
研究思路:
研究结果:
免疫系统在新冠肺炎病的早期受到抑制
重症新冠肺炎病患者的免疫反应被激活
研究结论:
该工作采用了4D-蛋白质组方法,揭示了感染初期免疫抑制和COVID-19患者紧密相关。与早期相比,在感染的后期,免疫反应在一定程度上被激活。这些研究提供了与COVID-19疾病相关的分子变化图谱,并为可能发生的两期发病机制提供了线索。
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