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定量蛋白组

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定量蛋白组
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1.产品介绍

定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是蛋白质组学研究领域最重要的应用之一。通过定量蛋白质组学技术,可以对样本中表达的全部蛋白质进行鉴定和定量,筛选样本或分组之间差异表达蛋白质,结合生物信息分析预测差异蛋白质功能,解析生理病理机制。

  基于质谱检测技术的定量蛋白质组学技术根据是否加标记可以分为两大类:非标定量技术,包括Label-free和DIA,标记定量技术,包括TMT和iTRAQ。

  定量蛋白质组技术根据数据采集模式分为数据依赖性的扫描模式(Data-dependent acquisition, DDA)和数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)。Label-free,TMT/iTRAQ 采用的都是DDA模式。

  常见定量蛋白组技术比较如下表:

  

 

  2.文献案例

  Novel scheme for non-invasive gut bioinformation acquisition with a magnetically controlled sampling capsule endoscope

  关键词:新冠、蛋白组、TMT

  期刊:Cell

  IF:38.637

  发表时间:2021

  详细解读点击链接查看:Cell最新文章——新冠逝者多组织蛋白质分子病理全景图https://mp.weixin.qq.com/s/IUnrpnmGj1IPn3zsHpixZg)

  研究路线:

  

 

  研究结果:

  1. 蛋白质组学概况:共鉴定到11394种蛋白质,5336种显著差异蛋白质。

  

 

  2. SARS-CoV-2感染相关的6类蛋白质: 重点研究了6类蛋白质,包括病毒受体和蛋白酶,转录因子(TF),细胞因子(及其受体),凝血系统,血管生成相关蛋白以及与SARS-CoV-2感染相关的纤维化标记物。

  

 

  3. 多组织凝血,血管生成和纤维化:蛋白组数据表明COVID-19系统性凝血,血管生成和纤维化失调,蛋白质翻译,葡萄糖和脂肪酸代谢失调。

  

 

  4. 组织间交流:肺蛋白质组显示了独特的途径富集,脾脏和肺部表现出相似的免疫反应模式,睾丸损伤。

  

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