多组学产品

Multi-omics products

转录组测序

代谢组+转录组

代谢组+LncRNA

代谢组+蛋白质组+转录组

代谢组+微生物组学

代谢组+重测序

蛋白组与代谢组联合分析

16S/ITS/18S扩增子测序

动植物全基因组重测序

动植物基因组组装

宏基因组

代谢组+蛋白质组+转录组

系统发育学是指基因组转录成转录组，转录组翻译成蛋白质组，蛋白质控制代谢物的合成，代谢物的积累导致生物表型的出现。单独用一种组学对系统生物学进行研究，往往比较片面，整合多组学分析是目前综合分析代谢产物的最有效的方法。转录组-蛋白质组数据彼此关联，依据的是mRNA与蛋白之间的翻译关系，通过此关系将mRNA与其翻译的蛋白整合，即通过蛋白ID查找与之匹配的转录本数据。

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dz4

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多组学产品与服务

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产品描述

　　1.产品简介：

　　系统发育学是指基因组转录成转录组，转录组翻译成蛋白质组，蛋白质控制代谢物的合成，代谢物的积累导致生物表型的出现。单独用一种组学对系统生物学进行研究，往往比较片面，整合多组学分析是目前综合分析代谢产物的最有效的方法。转录组-蛋白质组数据彼此关联，依据的是 mRNA 与蛋白之间的翻译关系，通过此关系将 mRNA 与其翻译的蛋白整合，即通过蛋白 ID 查找与之匹配的转录本数据。蛋白与代谢

　　2.应用领域：

　　◆ 植物生长发育机制研究

　　◆ 植物生物胁迫机制研究

　　◆ 植物非生物胁迫机制研究

　　◆ 蔬果花卉色泽营养代谢研究

　　◆ 药用植物功能活性成分通路探究

　　◆ 动物遗传育种

　　◆ 动物营养品质研究

　　◆ 动物疾病研究

　　3.技术路线：

　　4.样本要求

	转录组	蛋白质组	广靶
新鲜植物组织	新鲜植物组织：≥500mg ，根：≥1000mg，果实：≥1500mg	鲜重≥1g	建议3g，最低1g
新鲜动物组织	≥300mg	≥200mg；	建议200mg，最低50mg；
细胞	≥5×10⁶	≥5×10⁶ 或细胞沉淀不少于50μL；	建议1×10⁷，最低1×10⁶；

　　5.分析内容：

分析内容

　　6.文章案例：

　　Transcriptomic, proteomic, and metabolomic landscape of positional memory in the caudal fin of zebrafish

　　多组学联合分析解析斑马鱼尾鳍位置记忆组织再生新视角

　　◆ 期刊：PNAS

　　◆ 影响因子：9.661

　　◆ 发表时间：2017年

　　方案设计：

　　1. 对未受伤的斑马鱼尾鳍近端，中间和远端区域进行了RNA测序和蛋白质组学检测，筛选位置差异基因及蛋白;

　　2. 质谱对未损伤尾鳍的近端，中间和远端区域进行代谢组检测，筛选位置差异代谢物;

　　3. 对剪掉尾鳍0，1，3天再生鳍背侧和远侧区域进行蛋白质组检测，筛选与再生相关蛋白

　　结果：

　　位置记忆赋予再生组织两个关键属性。首先，离身体近端的截肢比远端截肢的再生更快。第二，新的组织是有图案的。只有损伤部位远端的结构才能再生。跨膜受体Prod1是位置记忆唯一真正的效应者。除Prod1外，小分子维甲酸(RA)也被报道为两栖类肢体位置记忆的效应物。未受伤的斑马鱼尾鳍上RNAs，蛋白质和代谢物的检测，确定了32个基因和42个代谢物的高信度列表，这些斑马鱼是位置记忆的候选效应子。

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　　Rabinowitz Jeremy S,Robitaille Aaron M,Wang Yuliang et al. Transcriptomic, proteomic, and metabolomic landscape of positional memory in the caudal fin of zebrafish.[J] .Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2017, 114: E717-E726.

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