多组学产品

Multi-omics products

转录组测序

代谢组+转录组

代谢组+LncRNA

代谢组+蛋白质组+转录组

代谢组+微生物组学

代谢组+重测序

蛋白组与代谢组联合分析

16S/ITS/18S扩增子测序

动植物全基因组重测序

动植物基因组组装

宏基因组

代谢组+转录组

转录组是获得生物体内基因表达的重要方法，代谢组是生物体表型的基础和直接体现者。代谢产物是生物体在内外调控下基因转录的最终结果，是生物体表型的物质基础。在系统生物学研究时代，生物发育过程复杂多变，基因调控网络复杂，单独用一种组学对系统生物学进行研究，往往比较片面。利用转录组的数据获得大量差异表达的基因，与代谢组检测得到的差异代谢物进行关联分析，从原因和结果两个层次分析生物体的内在变化，锁定与代谢物变化重点通路，构建核心调控网络，全面探究生物的生长发育及胁迫机制，从整体上解释生物学问题。

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产品编号

dz2

所属分类

多组学产品与服务

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产品描述

　　1.产品简介：

　　2.应用领域：

　　◆ 植物生长发育机制研究

　　◆ 植物生物胁迫机制研究

　　◆ 植物非生物胁迫机制研究

　　◆ 蔬果花卉色泽营养代谢研究

　　◆ 药用植物功能活性成分通路探究

　　◆ 动物遗传育种

　　◆ 动物营养品质研究

　　◆ 动物疾病研究

　　3.技术路线：

　　4.样本要求：

	广靶	动物脂质	转录组
新鲜植物组织	建议3g，最低1g	--	新鲜植物组织：≥500mg ，根：≥1000mg，果实：≥1500mg
新鲜动物组织	建议200mg，最低50mg；	建议200mg，最低50mg	≥300mg
细胞	建议1×107，最低1×106；	最低1×106，建议1×107	≥5×106

　　RNA要求：

　　样品浓度：≥50 ng/ul

　　样品体积：>10ul

　　样品总量：>3ug

　　RIN≧6.8 (动物)、6.3(植物、真菌)

　　分析内容：

　　5.文章案例：

　　The Asian corn borer Ostrinia furnacalis feedingincreasesthe direct and indirect defence ofmid-whorl stagecommercial maize in the field

　　亚洲螟取食对玉米心叶中期直接和间接的伤害

　　◆ 期刊：Plant Biotechnology Journal

　　◆ 影响因子：IF= 6.305

　　◆ 发表时间：2019年1月

　　方案设计：

　　1.收集玉米螟取食0,2,4,12,24h后的玉米叶片进行转录组检测，寻找与抗虫相关差异基因;

　　2.收集玉米螟取食后的0,2,4,8,12h的玉米叶片进行JA,JA-ILE,SA 和ABA检测，并筛选与抗虫相关激素基因;

　　3.收集玉米螟取食后的0，24，48，72h的玉米叶片进行苯丙恶嗪类代谢物检测;

　　4.用对照叶片和玉米螟取食24h后叶片喂养玉米螟，观察玉米螟的生理状态;

　　5.收集玉米螟取食0.2,4,12,24,48,72h，叶片进行挥发性代谢物检测，及挥发性物质对玉米螟的天敌腰带长体茧蜂的偏好性检测。

　　结果：

　　1.玉米螟取食后玉米叶片转录组分析发现，黄酮类，苯丙素类，单萜类，和苯并恶嗪类的生物合成，以及与植物防御相关的其他代谢途径发生明显变化，qPCR结果与转录组一致;

　　2.玉米螟取食后，激素及其差异基因分析发现，JA及其通路合成基因发生上调;

　　3.玉米螟取食后，苯丙恶嗪类代谢物及其通路基因发生显著变化;

　　4.用玉米螟取食24h后的叶片去喂食玉米螟，其生长指标与对照相比下降显著;

　　5.玉米螟取食后玉米叶片的挥发性物质对茧蜂具有明显诱导作用。

　　案例2：

　　Proteomics integrated with metabolomics: analysis of the internal causes of nutrient changes in alfalfa at different growth stages

　　◆ 期刊：Environmental Pollution

　　◆ 影响因子：IF=4.35

　　◆ 发表时间：2017年7月

　　方案设计：

　　1)选择不同浓度BPA溶液(对照，4.4mMBPA，8.8 mMBPA, 17.5 mMBPA)对受精后2h斑马鱼胚胎进行暴露处理 ;

　　2)暴露处理斑马鱼胚胎120h后，取样进行代谢组检测和分析，代谢组样品为4组样本;

　　3)暴露处理斑马鱼胚胎120h后，选择对照组和17.5mMBPA处理组斑马鱼胚胎进行转录组测序;

　　4)对差异代谢物及差异基因KEGG分析，相关性分析，解析暴露于BPA环境中，斑马鱼胚胎代谢机制的变化;

　　结果分析：

　　1.BPA处理后的斑马鱼代谢检测：高浓度BPA处理对斑马鱼胚胎影响较大，BPA处理对核苷酸及氨基酸代谢通路相关;

　　2.转录组分析：差异基因KEGG分析雌激素刺激和异生素，氧化还原过程，代谢过程发生显著变化。

　　3.联合分析：差异代谢物相关性分析及通路分析显示，视黄醇及花生四烯酸通路在BPA处理后收到显著影响;

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　　6.参考文献：

　　1.Fan Wenqiang,Ge Gentu,Liu Yinghao et al. Proteomics integrated with metabolomics: analysis of the internal causes of nutrient changes in alfalfa at different growth stages.[J] .BMC Plant Biol., 2018, 18: 78.

　　2.Guo Jingfei,Qi Jinfeng,He Kanglai et al. The Asian corn borer Ostrinia furnacalisfeeding increases the direct and indirect defence of mid-whorl stage commercialmaize in the field.[J] .Plant Biotechnol. J., 2019, 17: 88-102.

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