蛋白组产品
Proteome Products
1.产品简介：
定量蛋白质组学（Quantitative Proteomics）是蛋白质组学研究领域最重要的应用之一。通过定量蛋白质组学技术，可以对样本中表达的全部蛋白质进行鉴定和定量，筛选样本或分组之间差异表达蛋白质，结合生物信息分析预测差异蛋白质功能，解析生理病理机制。基于质谱检测技术的定量蛋白质组学技术根据是否加标记可以分为两大类：非标定量技术，包括Label-free和DIA，标记定量技术，包括TMT和iTRAQ。
定量蛋白质组技术根据数据采集模式分为数据依赖性的扫描模式(Data-dependent acquisition, DDA)和数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)。Label-free，TMT/iTRAQ 采用的都是DDA模式。
常见定量蛋白组技术比较如下表：
2.文献案例：
The proteome landscape of the kingdoms of life
关键词：蛋白组、多物种
- 期刊：Nature
- IF：42.778
- 发表时间：2020
研究路线：
19个古生菌，49个细菌和32个真核生物总共100个不同的物种进行蛋白组检测。
研究结果：
1.跨生命树蛋白质组学：鉴定到200万个肽段，340,000个蛋白质；
2.筛选100个物种中高丰度的蛋白（因为这些蛋白功能较为保守和基础），其中真核生物有1546个蛋白质，细菌中有306个，古菌中有262个；分析蛋白质相互作用关系，构建800多万个节点和5380万个关系对的网络图；
3.某些种类的蛋白质只在特定的生命分支中占优势，比如与光合作用相关的蛋白质只存在于光合自养生物体中，如植物、藻类、原生动物或蓝藻细菌(100个生物体中的13个)。
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