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蛋白组+代谢组联合分析

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产品编号
DB11
所属分类
蛋白组产品
数量
-
+
库存:
1
产品描述

  1.产品简介:

 

  单组学对于生物学问题的解析比较片面,通过蛋白组和代谢组联合分析,可以对来自蛋白质组与代谢组两个生物分子层次的批量数据进行归一化处理、比较分析和相关性分析等统计学分析,建立不同层次分子间数据关系。同时结合GO功能分析、代谢通路富集、分子互作等生物功能分析,系统全面地解析生物分子功能和调控机制。对两个分子层次的组学数据进行整合分析一方面可以相互验证,另一方面也有助于相互补充,最终实现对生物变化大趋势与方向的综合了解,提出分子生物学变化机制模型,并筛选出重点代谢通路或者蛋白质,代谢产物进行后续深入实验分析与应用。

 

  2.技术优势:

 

  ◆ 相互验证,相互补充;

   结果更可靠,数据更丰富;

  ◆ 全面解析生物学问题。

  

  3.技术路线:

 

 

 

 

  4.分析内容:

 

 

 

 

 

  5.样本要求:

 

 

        蛋白组样本要求:

 

 

        代谢组样本要求:

 

 

       一份样本分成两份,分别用于蛋白组和代谢组检测,液氮速冻,-80冰箱保存,干冰运输。  

 

 

 6.文章案例:

 

Tissue-specific study across the stem of Taxus media identifies a phloem-specific TmMYB3 involved in the transcriptional regulation of paclitaxel biosynthesis

 

关键词:紫杉醇、蛋白组、代谢组

 

  • 期刊:The Plant Journal
  • IF:6.141
  • 发表时间:2020

 

研究路线:


常见紫杉类PTX (paclitaxel ), DAP (10-deacetylpaclitaxel ), BAC (baccatin III )和10-DAB (10-Deacetylbaccatin )的皮层,韧皮部,木质部和髓部4个组织进行蛋白组和代谢组检测

 

研究结果:


1.不同组织中差异表达蛋白的分布:共鉴定到5604个蛋白,鉴定到了9个经典的TFs,其中MYB3,NAC25和GATA9样蛋白主要积累在韧皮部,提示其可能参与韧皮部紫杉醇积累调控。

 

 

 

 

2.不同组织中代谢物的差异分布:共鉴定到5162个潜在的代谢物,根据四个组织特异性的差异代谢物(DAMs)将其分成四组,Cluster I- Cluster IV的代谢物分别主要积累在皮层、韧皮部、髓部和皮层/韧皮部。

 

 

  

3.蛋白组代谢组整合分析:共鉴定到紫杉醇生物合成过程中12个关键中间代谢物和10个关键酶,其中大部分酶主要在韧皮部产生。

 

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