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蛋白组+代谢组联合分析

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产品描述

1.产品简介

      单组学对于生物学问题的解析比较片面,通过蛋白组和代谢组联合分析,可以对来自蛋白质组与代谢组两个生物分子层次的批量数据进行归一化处理、比较分析和相关性分析等统计学分析,建立不同层次分子间数据关系。同时结合GO功能分析、代谢通路富集、分子互作等生物功能分析,系统全面地解析生物分子功能和调控机制。对两个分子层次的组学数据进行整合分析一方面可以相互验证,另一方面也有助于相互补充,最终实现对生物变化大趋势与方向的综合了解,提出分子生物学变化机制模型,并筛选出重点代谢通路或者蛋白质,代谢产物进行后续深入实验分析与应用。

 

2.技术特点

相互验证,相互补充

结果更可靠,数据更丰富

全面解析生物学问题

 

3.技术路线

 

 

 

4.分析内容

 

 

 

  1. 样本要求

蛋白组样本要求

样本类型

建议样本量

最低样本量

生物学重复

动物组织

100mg

50mg

3-5

血浆/血清

50μL

20μL

3-5

细胞

1×106

5×105

3

代谢组样本要求

样本类型

建议样本量

最低样本量

生物学重复

动物组织

20mg

10mg

6

血浆/血清

20μL

10μL

6

细胞

1×107

5×106

3

一份样本分成两份,分别用于蛋白组和代谢组检测,液氮速冻,-80冰箱保存,干冰运输。

 

6.文章案例

Omics study reveals abnormal alterations of breastmilk proteins and metabolites in puerperant women with COVID-19

关键词:新冠、蛋白组、代谢组

期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy

IF:13.493

发表时间:2020

点击链接查看更多解读(客户文章 | 多组学研究揭示COVID-19对产妇母乳蛋白质和代谢物的异常改变https://mp.weixin.qq.com/s/WEqfoEgyOYTW8KTJ9QctiQ

研究路线:

4名COVID-19产妇和2名健康产妇分娩后3天的初乳样本,进行蛋白质组学、脂质组学和代谢组学检测

研究结果

  1. 蛋白组分析:初乳样品中总共1715个蛋白质,PCA显示COVID-19患者和健康志愿者的母乳可以大致分离,鉴定到了88种差异表达蛋白,许多参与免疫应答的母乳蛋白在COVID-19下调。

 

 

 

  1. 脂质组分析:共鉴定了504种脂质,在主成分分析(PCA)中,COVID-19患者和健康对照者的分离并不清楚,且仅有13个脂质发生显著变化。

 

 

  1. 代谢组分析:共鉴定了340种代谢物,COVID-19患者母乳中吲哚及其衍生物的水平降低,可能是由炎症反应引起的,蛋白质消化和吸收、色氨酸代谢等途径激活。

4.蛋白组和代谢组联合分析:差异蛋白质和差异代谢物构建调控网络图,揭示蛋白质和代谢物相互作用。

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